2000 yılında Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi’nden mezun oldu. 2007 yılında Kocaeli Üniversitesi Tıp Fakültesi İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı’nda ihtisasını tamamladı. 2007-2010 yılları arasında Dr. İ. Şevki Atasagun Nevşehir Devlet Hastanesi’nde mecburi hizmet yaptı. 2010-2013 yılları arasında Balıkesir Üniversitesi Tıp Fakültesi İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı’nda Yardımcı Doçent olarak çalıştı ve bu süreçte Anabilim Dalı Başkanlığı yaptı. 2014-2018 yılları arasında Başkent Üniversitesi İstanbul Sağlık Uygulama ve Araştırma Merkezi, İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji bölümünde çalıştı. 2017 yılında Doçent, 2022 yılında profesör ünvanı aldı. Halen Sağlık Bilimleri Üniversitesi Ümraniye Eğitim Araştırma Hastanesi’nde çalışıyor. Türk Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları (KLİMİK) Derneği, Avrupa Klinik Mikrobiyoloji ve İnfeksiyon Hastalıkları Derneği (ESCMID), Türkiye Organ Nakli Derneği, The Transplantation Society üyelikleri bulunan Prof. Dr. Mehtap Aydın, KLİMİK Sağlık Bakımıyla İlişkili İnfeksiyonlar Çalışma Grubu yönetim kurulu üyesidir. 2019-2021 döneminde yönetim kurulu üyeliğine seçilmiş, 2021-2023 ve 2023-2025 döneminde tekrar seçilerek sayman olarak görev almıştır.